Le CAE dispose des compétences de 150 spécialistes.

Il réalise notamment les analyses nécessaires au contrôle sanitaire de l'eau au quotidien.

Il propose des méthodes d'analyses mettant en oeuvre les dernières avancées technologiques (biologie moléculaire, technique, spectroscopique, etc.) pour des détections de plus en plus fines et rapides des paramètres émergents comme les perturbateurs endocriniens et les résidus pharmaceutiques.